[ search · endpoint ]API de recherche · Génomique

API de recherche jeux de données de recherche

Interrogez NCBI SRA, GEO, BioSample, BioProject, dbGaP et Taxonomy depuis un seul endpoint. JSON pré-formaté avec accessions, plateformes, stratégies et organismes pour la découverte de jeux de données omiques par IA.

30 crédits / appel60 req / minPOST /api/search/genomics-datasets

Qu'est-ce que API de recherche jeux de données génomiques ?

Recherche sémantique sur NCBI SRA, GEO, BioSample, BioProject, dbGaP et Taxonomy. Renvoie des enregistrements classés avec URLs sources prêts pour les LLM.

Infos clés
Endpoint
POST /api/search/genomics-datasets
Authentification
Clé API · en-tête x-api-key
Coût
30 crédits / appel
Limite de débit
60 req / min
Réponse
JSON structuré
[ 01 · live ]

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auth · x-api-key

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5 requêtes d'exemple — cliquez pour charger
[ 02 · integrate ]

Guide d'intégration

Copiez un extrait, remplacez votre clé API, exécutez. Fonctionne avec n'importe quel client HTTP — exemples ci-dessous en cURL, JavaScript et Python.

spec
POST/api/search/genomics-datasets
base
https://www.apipick.com

Recherche sémantique sur NCBI SRA, GEO, BioSample, BioProject, dbGaP et Taxonomy. Renvoie des enregistrements classés avec URLs sources prêts pour les LLM.

paramètres
querystringrequis

Natural-language search query

max_num_resultsintegeroptionnel

1–5, default 5

relevance_thresholdnumberoptionnel

0.0–1.0 quality filter

curl -X POST "https://www.apipick.com/api/search/genomics-datasets" \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -H "x-api-key: YOUR_API_KEY" \
  -d '{
  "query": "RNA-seq human liver SRA runs",
  "max_num_results": 5
}'
● 200 · réponse
{
  "query": "RNA-seq human liver SRA runs",
  "results": [
    {
      "title": "Example result",
      "url": "https://example.com/article",
      "snippet": "Short excerpt of the page content…",
      "source_type": "web",
      "published_at": "2026-04-15",
      "score": 0.92
    }
  ],
  "result_count": 1,
  "credits_used": 30,
  "remaining_credits": 99
}
[ 03 · limits ]

Limites de débit

La limitation est par clé API, fenêtre glissante de 60 secondes. En cas de dépassement, vous recevez un 429 propre avec un en-tête Retry-After.

débit de requêtes

60req/min

Par clé API, par endpoint. Fenêtre glissante de 60 secondes.

concurrence

3concurrent

Nombre maximal de requêtes simultanées en cours par clé API.

en-têtes de réponse
X-RateLimit-LimitNombre maximal de requêtes autorisées par minute
X-RateLimit-RemainingRequêtes restantes dans la fenêtre actuelle
X-RateLimit-ResetSecondes avant la réinitialisation de la fenêtre actuelle
Retry-AfterSecondes à attendre avant de réessayer (uniquement sur 429)
● 429 · trop de requêtes
HTTP/1.1 429 Too Many Requests
Retry-After: 12
X-RateLimit-Limit: 60
X-RateLimit-Remaining: 0
X-RateLimit-Reset: 12

{
  "error": "rate_limit_exceeded",
  "message": "Rate limit exceeded: 60 requests/minute per API key. Retry after 12s.",
  "retry_after": 12
}
[ faq ]

Questions fréquentes

01

Pourquoi 30 crédits par appel ?

SRA, GEO et les autres bases d'archives NCBI sont de vastes dépôts fréquemment mis à jour qui nécessitent une maintenance d'index permanente, donc l'endpoint coûte 30 crédits (≈ 0,03 $ par appel).

02

Quelles sources sont couvertes ?

NCBI SRA (runs de séquençage), GEO (jeux de données d'expression génique), BioSample, BioProject, dbGaP (génotype–phénotype) et Taxonomy. Toutes sont interrogées en parallèle et classées ensemble.

03

Puis-je chercher par étude, organisme ou dosage ?

Oui. Passez une accession, un organisme, un type de dosage ou une requête en langage naturel comme « RNA-seq foie humain » et l'endpoint classe les jeux de données les plus pertinents.

04

Quels champs sont renvoyés ?

Les enregistrements incluent titres, accessions, organisme, plateforme/instrument, stratégie de séquençage et taille du jeu de données lorsqu'elle est disponible, ainsi qu'un lien vers l'enregistrement NCBI.

05

Schéma d'outil pour OpenAI / Claude ?

GET /api/search/genomics-datasets/tool-schema renvoie des définitions prêtes à coller de fonction OpenAI et d'utilisation d'outil Claude.

[ explore ]

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