Forschungsdatensätze-Such-API
Frage NCBI SRA, GEO, BioSample, BioProject, dbGaP und Taxonomy über einen einzigen Endpunkt ab. Vorformatiertes JSON mit Accessions, Plattformen, Strategien und Organismen für die KI-gestützte Entdeckung von Omics-Datensätzen.
Was ist Genomik-Datensätze-Such-API?
Semantische Suche über NCBI SRA, GEO, BioSample, BioProject, dbGaP und Taxonomy. Liefert gerankte Datensätze mit Quell-URLs, bereit für nachgelagerte LLMs.
- Endpoint
- POST /api/search/genomics-datasets
- Authentifizierung
- API-Key · x-api-key-Header
- Kosten
- 30 Credits / Aufruf
- Rate-Limit
- 60 Anf./Min.
- Antwort
- Strukturiertes JSON
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Integrationsleitfaden
Snippet kopieren, deinen API-Key einsetzen, ausführen. Funktioniert in jedem HTTP-Client — Beispiele unten in cURL, JavaScript und Python.
/api/search/genomics-datasetshttps://www.apipick.comSemantische Suche über NCBI SRA, GEO, BioSample, BioProject, dbGaP und Taxonomy. Liefert gerankte Datensätze mit Quell-URLs, bereit für nachgelagerte LLMs.
querystringerforderlichNatural-language search query
max_num_resultsintegeroptional1–5, default 5
relevance_thresholdnumberoptional0.0–1.0 quality filter
curl -X POST "https://www.apipick.com/api/search/genomics-datasets" \
-H "Content-Type: application/json" \
-H "x-api-key: YOUR_API_KEY" \
-d '{
"query": "RNA-seq human liver SRA runs",
"max_num_results": 5
}'{
"query": "RNA-seq human liver SRA runs",
"results": [
{
"title": "Example result",
"url": "https://example.com/article",
"snippet": "Short excerpt of the page content…",
"source_type": "web",
"published_at": "2026-04-15",
"score": 0.92
}
],
"result_count": 1,
"credits_used": 30,
"remaining_credits": 99
}Rate-Limits
Die Drosselung erfolgt pro API-Key, gleitendes 60-Sekunden-Fenster. Beim Erreichen des Limits bekommst du ein sauberes 429 mit Retry-After-Header.
60req/min
Pro API-Key, pro Endpunkt. Gleitendes 60-Sekunden-Fenster.
3concurrent
Maximale gleichzeitige laufende Anfragen pro API-Key.
X-RateLimit-LimitMaximal zulässige Anfragen pro MinuteX-RateLimit-RemainingVerbleibende Anfragen im aktuellen FensterX-RateLimit-ResetSekunden bis zum Zurücksetzen des aktuellen FenstersRetry-AfterSekunden Wartezeit vor erneutem Versuch (nur bei 429)HTTP/1.1 429 Too Many Requests
Retry-After: 12
X-RateLimit-Limit: 60
X-RateLimit-Remaining: 0
X-RateLimit-Reset: 12
{
"error": "rate_limit_exceeded",
"message": "Rate limit exceeded: 60 requests/minute per API key. Retry after 12s.",
"retry_after": 12
}Häufig gestellte Fragen
Warum 30 Credits pro Aufruf?
SRA, GEO und die übrigen NCBI-Archivdatenbanken sind große, häufig aktualisierte Repositorien mit fortlaufender Indexpflege, daher kostet der Endpunkt 30 Credits (≈ 0,03 $ pro Aufruf).
Welche Quellen sind abgedeckt?
NCBI SRA (Sequenzierungsläufe), GEO (Genexpressions-Datensätze), BioSample, BioProject, dbGaP (Genotyp–Phänotyp) und Taxonomy. Alle werden parallel abgefragt und gemeinsam gerankt.
Kann ich nach Studie, Organismus oder Assay suchen?
Ja. Übergib eine Accession, einen Organismus, einen Assay-Typ oder eine Anfrage in natürlicher Sprache wie „RNA-seq menschliche Leber“, und der Endpunkt rankt die relevantesten Datensätze.
Welche Felder kommen zurück?
Datensätze enthalten Titel, Accessions, Organismus, Plattform/Gerät, Sequenzierungsstrategie und, sofern verfügbar, die Datensatzgröße sowie einen Link zum NCBI-Datensatz.
Tool-Schema für OpenAI / Claude?
GET /api/search/genomics-datasets/tool-schema liefert einsatzbereite OpenAI-Funktions- und Claude-Tool-Use-Definitionen.
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